代谢组学相关数据库（及常用软件）

常用的代谢组相关数据库包括人类代谢组数据库（HMDB）、KEGG数据库、Reactome数据库等，介绍如下： 人类代谢组数据库（HMDB）是代谢组学中比较流行的数据库之一，包括人类小分子的详细信息体内发现的分子代谢物，不少于79,031个代谢物条目。 SMPDB 数据库与 HMDB 链接，包含大约 700 条人类代谢和疾病途径的途径图。 KEGG数据库是流行的代谢组数据库之一，包含代谢途径和相互作用网络的信息。 Reactome数据库主要收集人体主要代谢途径和重要反应的信息。 MassBank数据库主要收集许多高分辨率低代谢成分的光谱。

BioCyc 数据库包含途径和基因组数据。 METLIN 数据库是一个商业代谢组和串联质谱数据库，包含约 43,000 种代谢物和 22,000 个 MS/MS 谱图。 FiehnLib 数据库是一个商业代谢组数据库，包含约 1000 个保守代谢物的 EI 谱。

NIST/EPA/NIH 质谱库数据库也是一个商业代谢组数据库，包含超过 190,000 个 EI 谱图。 BioCyc 数据库收集途径和基因组数据，并且免费提供。 MetaCyc 数据库全面收集了许多不同生物体的代谢途径和酶的信息，包括 51,000 多篇文章。 MMCD数据库收集了10,000多种代谢物的信息及其MS和NMR数据，其中大部分是拟南芥代谢物。